Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CREB3L3Q68CJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CREB3L3Q68CJ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CREB3L3Q68CJ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms