Protein–RNA interactions for Protein: Q5XUX1

FBXW9, F-box/WD repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW9Q5XUX1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXW9Q5XUX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXW9Q5XUX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FBXW9Q5XUX1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms