Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
C9orf84Q5VXU9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
C9orf84Q5VXU9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
C9orf84Q5VXU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.15■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
C9orf84Q5VXU9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
C9orf84Q5VXU9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms