Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GARNL3Q5VVW2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GARNL3Q5VVW2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GARNL3Q5VVW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms