Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC7Q5VTL7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC7Q5VTL7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC7Q5VTL7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms