Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms