Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
BEND3Q5T5X7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BEND3Q5T5X7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BEND3Q5T5X7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BEND3Q5T5X7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BEND3Q5T5X7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BEND3Q5T5X7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms