Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3LQ5T215 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3LQ5T215 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3LQ5T215 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3LQ5T215 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC3LQ5T215 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC3LQ5T215 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC3LQ5T215 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRAPPC3LQ5T215 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRAPPC3LQ5T215 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms