Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MARCH8Q5T0T0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MARCH8Q5T0T0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MARCH8Q5T0T0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MARCH8Q5T0T0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms