Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CEP170Q5SW79 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CEP170Q5SW79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
CEP170Q5SW79 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
CEP170Q5SW79 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CEP170Q5SW79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CEP170Q5SW79 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms