Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDKL4Q5MAI5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKL4Q5MAI5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKL4Q5MAI5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKL4Q5MAI5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms