Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SLC27A3Q5K4L6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLC27A3Q5K4L6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLC27A3Q5K4L6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms