Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FRMPD3Q5JV73 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMPD3Q5JV73 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMPD3Q5JV73 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMPD3Q5JV73 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms