Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPIN3Q5JUX0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPIN3Q5JUX0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIN3Q5JUX0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms