Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFDP3Q5H9I0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFDP3Q5H9I0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TFDP3Q5H9I0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TFDP3Q5H9I0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms