Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HERC4Q5GLZ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HERC4Q5GLZ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HERC4Q5GLZ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HERC4Q5GLZ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms