Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SGO2Q562F6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SGO2Q562F6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SGO2Q562F6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SGO2Q562F6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms