Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EIPR1Q53HC9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIPR1Q53HC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EIPR1Q53HC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIPR1Q53HC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms