Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GREB1Q4ZG55 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GREB1Q4ZG55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GREB1Q4ZG55 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GREB1Q4ZG55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms