Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PABPC1LQ4VXU2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PABPC1LQ4VXU2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PABPC1LQ4VXU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PABPC1LQ4VXU2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms