Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSM12Q3MHD2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM12Q3MHD2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM12Q3MHD2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms