Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP25-1Q3LHN0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP25-1Q3LHN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms