Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms