Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC4A8Q2Y0W8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SLC4A8Q2Y0W8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms