Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM71Q2Q1W2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM71Q2Q1W2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM71Q2Q1W2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM71Q2Q1W2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms