Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SGSM1Q2NKQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SGSM1Q2NKQ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SGSM1Q2NKQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGSM1Q2NKQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGSM1Q2NKQ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGSM1Q2NKQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms