Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PTPROQ16827 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPROQ16827 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPROQ16827 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPROQ16827 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
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