Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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