Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPP1R3AQ16821 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PPP1R3AQ16821 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPP1R3AQ16821 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms