Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RTN1Q16799 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RTN1Q16799 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RTN1Q16799 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RTN1Q16799 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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