Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CA9Q16790 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CA9Q16790 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA9Q16790 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA9Q16790 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA9Q16790 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA9Q16790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA9Q16790 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CA9Q16790 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CA9Q16790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CA9Q16790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CA9Q16790 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CA9Q16790 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CA9Q16790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CA9Q16790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CA9Q16790 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA9Q16790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA9Q16790 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA9Q16790 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CA9Q16790 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA9Q16790 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CA9Q16790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CA9Q16790 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CA9Q16790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CA9Q16790 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CA9Q16790 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA9Q16790 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CA9Q16790 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA9Q16790 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CA9Q16790 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA9Q16790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA9Q16790 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CA9Q16790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA9Q16790 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA9Q16790 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA9Q16790 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA9Q16790 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA9Q16790 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA9Q16790 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA9Q16790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA9Q16790 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CA9Q16790 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA9Q16790 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA9Q16790 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA9Q16790 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA9Q16790 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA9Q16790 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA9Q16790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA9Q16790 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA9Q16790 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA9Q16790 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA9Q16790 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA9Q16790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA9Q16790 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA9Q16790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA9Q16790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA9Q16790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA9Q16790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA9Q16790 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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