Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LAMA3Q16787 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LAMA3Q16787 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LAMA3Q16787 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LAMA3Q16787 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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