Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLPPQ16740 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLPPQ16740 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLPPQ16740 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLPPQ16740 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
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