Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACKR1Q16570 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACKR1Q16570 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACKR1Q16570 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACKR1Q16570 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms