Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPE65Q16518 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPE65Q16518 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPE65Q16518 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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