Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LAMA4Q16363 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LAMA4Q16363 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LAMA4Q16363 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMA4Q16363 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMA4Q16363 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
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