Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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RAB11BQ15907 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB11BQ15907 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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RAB11BQ15907 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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RAB11BQ15907 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RAB11BQ15907 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RAB11BQ15907 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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RAB11BQ15907 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB11BQ15907 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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RAB11BQ15907 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RAB11BQ15907 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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RAB11BQ15907 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RAB11BQ15907 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RAB11BQ15907 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB11BQ15907 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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