Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ALX1Q15699 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ALX1Q15699 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALX1Q15699 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALX1Q15699 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
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