Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TAF1AQ15573 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1AQ15573 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TAF1AQ15573 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAF1AQ15573 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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