Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SF3B3Q15393 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SF3B3Q15393 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SF3B3Q15393 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SF3B3Q15393 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SF3B3Q15393 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
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