Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRRQ15256 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRRQ15256 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRRQ15256 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRRQ15256 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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