Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK3Q15120 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDK3Q15120 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDK3Q15120 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDK3Q15120 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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