Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PDCD1Q15116 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PDCD1Q15116 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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