Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHPRHQ149N8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHPRHQ149N8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHPRHQ149N8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHPRHQ149N8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SHPRHQ149N8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
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