Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB33AQ14088 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RAB33AQ14088 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RAB33AQ14088 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB33AQ14088 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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