Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL9A2Q14055 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL9A2Q14055 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL9A2Q14055 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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