Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CACNA1SQ13698 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CACNA1SQ13698 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
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