Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ITGA7Q13683 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ITGA7Q13683 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ITGA7Q13683 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ITGA7Q13683 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
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