Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED1Q13445 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED1Q13445 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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