Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3B2Q13367 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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AP3B2Q13367 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B2Q13367 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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AP3B2Q13367 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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AP3B2Q13367 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
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AP3B2Q13367 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
AP3B2Q13367 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
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