Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTA1Q13330 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA1Q13330 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA1Q13330 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA1Q13330 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTA1Q13330 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTA1Q13330 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTA1Q13330 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTA1Q13330 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms